В основе учета успеваемости учащихся лицея лежат учебные планы лицея по соответствующим направлениям. Для того, чтобы произвести учет успеваемости учащихся лицея в системе за определенный учебный год, в справочнике  Учебные планы лицея должны быть заведены учебные планы, по которым учились учащиеся лицея в данном учебном году.

На основе учебных планов на определенный учебный год формируются учебные планы школьников. В учебный план школьника входят:

1. Учебные дисциплины составляющие обязательную часть учебного плана.
2. Предметы по выбору, включенные в учебный план.
3. Факультативы, включенные в учебный план.

Формирование учебного плана школьника на основе учебного плана лицея по определенному направлению подробно прдставлено в разделе Формирование учебных планов школьников.

Для каждой из записей учебного плана в системе создаются испытания рубежного контроля. Учет успеваемости заключается в занесении и дальнейшем анализе оценок школьников за испытания рубежного контроля по дисциплинам учебного плана. Каждое испытание рубежного контроля назначается в одном из периодов обучения, представленных в справочнике Календарные периоды обучения. Таблицы данных  Рубежный контоль по периодам, Итоговые результаты за год  и Итоговые результаты в аттестат  в разделе Учащиеся лицея-учеба  позволяет просматривать все испытания, запланированные в каждом учебном периоде и по окончании учебного года, формировать записи о сдачах и пересдачах испытаний школьниками, заносить оценки за испытания (подробнее - в разделе Учет результатов выполнения учебного плана школьниками). Также по каждому из назначенных испытаний можно просматривать результаты его сдачи школьниками.